Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms