Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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