Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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