Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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