Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms