Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms