Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chchd5Q9CQP3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms