Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms