Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.7 ms