Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms