Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms