Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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