Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ssxb1Q9CPU1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ssxb1Q9CPU1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ssxb1Q9CPU1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ssxb1Q9CPU1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ssxb1Q9CPU1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ssxb1Q9CPU1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ssxb1Q9CPU1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ssxb1Q9CPU1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ssxb1Q9CPU1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ssxb1Q9CPU1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb1Q9CPU1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Ssxb1Q9CPU1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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