Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR1

Rwdd4, RWD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd4Q9CPR1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rwdd4Q9CPR1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rwdd4Q9CPR1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rwdd4Q9CPR1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rwdd4Q9CPR1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rwdd4Q9CPR1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rwdd4Q9CPR1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rwdd4Q9CPR1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rwdd4Q9CPR1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rwdd4Q9CPR1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rwdd4Q9CPR1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms