Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms