Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrbp1Q99PL5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrbp1Q99PL5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrbp1Q99PL5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrbp1Q99PL5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrbp1Q99PL5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrbp1Q99PL5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrbp1Q99PL5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrbp1Q99PL5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrbp1Q99PL5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrbp1Q99PL5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrbp1Q99PL5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrbp1Q99PL5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrbp1Q99PL5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrbp1Q99PL5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrbp1Q99PL5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrbp1Q99PL5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrbp1Q99PL5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrbp1Q99PL5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrbp1Q99PL5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms