Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpin3Q99PI4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms