Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim3Q99PE5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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