Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms