Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms