Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms