Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms