Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ms4a4dQ99N05 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ms4a4dQ99N05 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ms4a4dQ99N05 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ms4a4dQ99N05 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ms4a4dQ99N05 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ms4a4dQ99N05 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ms4a4dQ99N05 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ms4a4dQ99N05 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ms4a4dQ99N05 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ms4a4dQ99N05 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ms4a4dQ99N05 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ms4a4dQ99N05 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ms4a4dQ99N05 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ms4a4dQ99N05 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ms4a4dQ99N05 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ms4a4dQ99N05 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ms4a4dQ99N05 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms