Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms