Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ3

Pink1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pink1Q99MQ3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms