Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
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PtprtQ99M80 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
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