Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms