Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms