Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms