Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms