Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms