Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms