Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms