Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms