Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GatbQ99JT1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GatbQ99JT1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GatbQ99JT1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GatbQ99JT1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GatbQ99JT1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GatbQ99JT1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GatbQ99JT1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GatbQ99JT1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GatbQ99JT1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GatbQ99JT1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
GatbQ99JT1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GatbQ99JT1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms