Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spef1Q99JL1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms