Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Smim11aQ99J19 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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