Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms