Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gtpbp3Q923K4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gtpbp3Q923K4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gtpbp3Q923K4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gtpbp3Q923K4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gtpbp3Q923K4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gtpbp3Q923K4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gtpbp3Q923K4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms