Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms