Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms