Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Clip1Q922J3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms