Protein–RNA interactions for Protein: Q921L3

Tmco1, Calcium load-activated calcium channel, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco1Q921L3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco1Q921L3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms