Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms