Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx4Q91YJ2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms