Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y10

Pcdhac1, Protocadherin alpha C1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhac1Q91Y10 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhac1Q91Y10 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhac1Q91Y10 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhac1Q91Y10 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhac1Q91Y10 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhac1Q91Y10 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhac1Q91Y10 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhac1Q91Y10 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms