Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms