Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 469.5 ms