Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms