Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Fam20bQ8VCS3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Fam20bQ8VCS3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Fam20bQ8VCS3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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